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《伤寒杂病论》原书共十六卷，内容包括伤寒和杂病两大部分，是论述外感疾病和内科杂病的专著，其中也包括有妇科和部分外科。此时正当三国时期，封建割据，战争频繁，以致原书散第三卷１６５失不全。后经西晋王叔和将原书伤寒部分整理成册，名为《伤寒论》。自此以后，又经东晋、南北朝分裂对立的局面，该书时隐时现。至唐·孙思邈撰《千金要方》时，对该书少数有所征引，似未窥全貌，故有“江南诸师秘仲景方而不传”之语。迨孙氏晚年撰《千金翼方》，则《伤寒论》全书，已大体载于卷九、卷十之中，可谓为《伤寒论》最早之版本，故清·王朴庄《伤寒论注》，即以此为蓝本。又唐·王焘著《外台秘要》四十卷，根据该书所载附引《伤寒论》条文，共为十八卷，前十卷与今本《伤寒论》略同，后八卷多为杂病部分，但与今之《金匮要略》又大不相同，故也称为唐旧本。到了宋代治平间，国家设立校正医书局，经高保衡、孙奇、林亿等加以校正。这时已发明印刷术，并重新刻板印行，称为宋版本。据林亿校定的序文说：“以为百病之急，无急于伤寒，今先校定张仲景《伤寒论》十卷，总二十二篇，证外合三百九十七法，除复重定有一百一十二方，今请颁行。”宋版本后已不见，仅存明·赵开美的复刻本，可能是治平本的真面目。全书共分十卷：第一卷，辨脉法第一，平脉法第二。第二卷，伤寒例，辨痉湿病脉证，辨太阳病脉证并治上。
第三卷，辨太阳病脉证并治中。第四卷，辨太阳病脉证并治下。第五卷，辨阳明病脉证并治，辨少阳病脉证并治。第六卷，辨太阴病脉证并治，辨少阴病脉证并治，辨厥阴病脉证并治。第七卷，辨霍乱病脉证并治，辨阴阳易差后劳复病脉证并治，辨不可发汗病脉证并治，辨可发汗病脉证并治。第八卷，辨发汗后病脉证并治，辨不可吐可吐。第九卷，辨不可下病脉证并治，辨可下病脉证并治。第十卷，辨发汗吐下后脉证并治。后经一些医家的考证，如明·洪武中，芗溪黄芪作《伤寒类证辨惑》曰：“仲景之书，六经到劳复而已，其间具三百九十七法，一百一十二方，纤悉具备，有条而不紊者也。辨脉法，伤寒例三篇，叔和采摭诸书，附以己意，虽间有仲景说，实三百九十七法之外者也。又痉湿三种一篇，出《金匮要略》，叔和虑与伤寒相似，故编入六经之右。
又有汗吐下、可不可并汗吐下后证，叔和重集于篇末，比主经中，仓卒易检易见也。今一以仲景书为正，其非仲景之书者，悉去之。庶使真伪必分，要理不繁，易于学者也”（转引自《伤寒论辑义》）。所以方、喻等注家均宗其说。现在通行版本均已去掉了辨脉、平脉、伤寒例、辨痉湿病脉证治等前四篇，以及辨不可发汗病脉证并治等后七篇，都是根据此说。
关于现在流传的宋金版本两种，一是上述的明赵开美复刻宋镌治平本（１０５６年）；一是金·成无己著《注解伤寒论》本（１１４４年），仍为十卷二十二篇，称为成注本。成本经明嘉靖间汪济川校刊。还有一种医统本，也是成无己的《注解伤寒论》，经明朝徐熔校刊，内容和汪刻本基本相同。以上是《伤寒论》的流传历史及版本形成的概况。至于《伤寒杂病论》杂病部分，后经整理成为《金匮要略》一书。
由于宋版本的刊行，使后世整理研究《伤寒论》，有了深入发展。如安常《伤寒总病论》，朱肱著《南阳活人书》，许叔微著《伤寒发微论》、《伤寒九十论》等。尤其金·成无己《注解伤寒论》，对《伤寒论》原文逐条加以注释，运用《内经》等理论进行阐述而发挥，对后学者启发很大，是重要的参考书籍。明清以来，《伤寒论》尊为医经之一，为医家必读之书。故继成氏之后，整理和注释《伤寒论》者，如王肯堂的《伤寒证治准绳》，方有执的《伤寒论条辨》，喻嘉言的《伤寒尚论篇》，张隐庵的《伤寒论集注》，程郊倩的《伤寒论后条辨》，周杨俊的《伤寒论三注》，张令韶的《伤寒论直解》，钱天来的《伤寒溯源集》，张路玉的《伤寒绪论》、《伤寒缵论》，柯韵伯的《伤寒来苏集》，尤在泾的《伤寒贯珠集》，徐灵胎的《伤寒类方》，陈修园的《伤寒论浅注》、《伤寒医诀串解》，唐容川的《伤寒论浅注补正》等，或循原书之旧而加以阐释，或阐发故说而间附后世类方，或以方类证，虽仁智之见各异，而醇中有疵，瑕不掩瑜，均对仲景学说有所昌明。特别值得提出第三卷１６６的是清代所纂的《医宗金鉴》，各科齐备，而编排次序以仲景全书为首，实昭示《伤寒论》在中医学中之重要地位。民元以后，恽铁樵著《伤寒论辑义按》，陆渊雷《伤寒论今释》，衷中参西，颇多发挥。（三）注重六经实质综合研究自宋以降，尤其是建国４０年来，诸家对六经病提出了各种看法，形成了百家争鸣的局面。
何谓六经：六经即太阳、阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴。六经之中，又分为手足二经，因而总领十二及所属脏腑。李氏认为，“历代医家有从脏腑、经络、气化、部位、阶段等方面来探讨六经的，这些研究方法，虽各有发挥，但也各有其片面性”（《全国高等医药院校教学参考书·伤寒论》）。因为脏腑是人体机能活动的核心，脏腑机能活动必然会影响全身各部，而全身各部之机能活动，也必然从属或影响脏腑。以脏腑的病理反映而论，在疾病的发展过程中，各经病变常会累及所系的脏腑，而出现脏腑的证候。如膀胱为太阳之腑，太阳表邪不解，传入于腑，致膀胱功能失常，水气内停，可见小便不利，少腹里急，烦渴或渴欲饮水，水入即吐等证。胃与大肠为阳明之腑，邪入阳明，胃燥热盛，津液受伤，则见身大热，汗自出，不恶寒，反恶热，口干舌燥，烦渴不解，脉洪大等证；若肠胃燥热结实，腑气不通，就会出现潮热，谵语，手足然汗出，腹胀满疼痛，拒按，大便秘结等证。胆与三焦为少阳之腑，胆火上炎，则有口苦，咽干，目眩；三焦失于通调，或水停心下，则心下悸，小便不利；呈水寒犯肺，则为咳；或少阳枢机不利，寒饮留中不化，则可见往来寒热，心烦，胸胁满微结，小便不利，渴而不呕，但头汗出等证。脾为太阴之脏，病则脾阳不振，运化失常，脾虚脏寒，寒湿停滞，可出现腹满而吐，食不下，自利，时腹自痛等证。心肾为少阴之脏，病则心肾虚衰，气血不足，可出现脉微细，但欲寐，恶寒，卧，甚则手足厥冷，下利或呕逆等一系列阳气虚衰、阴寒内盛之证；若心火太亢，肾阳不足，又可见心中烦，不得眠，咽干，舌质绛，脉细数等阴虚热甚之证。肝为厥阴之脏，病则寒热错杂，肝气上逆，可见消渴，气上撞心，心中疼热，饥而不欲食，食则吐蛔或下利等证候。脏腑的病变，应从多方面因素来予以研究。
经络根源于脏腑，网络全身，运行气血，既有独立的功能，又有从属脏腑的一面。以经络的病理反映而论，例如，足太阳经起于目内眦，上额交巅，下项挟脊抵腰到足，循行于人体之背部，故太阳受邪，则见头项痛，腰脊强等证。足阳明经起于鼻梁凹陷处两侧，络于目，并从缺盆下行经胸腹，循行于人体之前面，故阳明经受邪，则见目痛、鼻干等证。足少阳经起于目外眦，上抵头角，下耳后，入耳中，并从缺盆下行胸胁，循行人体之侧面，故少阳经受邪，可见耳聋、目赤、胸胁苦满等证。三阴属里证，其经络所反映的证候，虽不像三阳经那么显著，但其所表现的某些证候，如太阴病的腹满痛，少阳病的咽干、咽痛，厥阴病的巅顶痛等，均与其经络的循行部位有关。
所谓气化，是指风寒湿热燥火六气的变化。气化学说源于《素问》运气七篇，如《素问·至真第三卷１６７要大论》说：“夫百病之生也，皆生于风、寒、暑、湿、燥、火以之化之变也。”又“善言天者，必有验于人，善言古者，必有合于今，善言今者，必有彰于物。”（《素问·六微旨大论》）由于天人相应的关系，故六气不仅用来说明诸种气候致人于病的“之化之变”规律，而且也用来说明人体脏腑功能活动的变化。后世注家则大多藉此阐释六经疾病的病理演变。如《伤寒论》中，用桂枝汤治中风，麻黄汤治太阳伤寒，此为在表风寒而言。若理中汤（丸）治太阴脏寒，附子汤治纯阴无阳，通脉、白通二方治格阳、戴阳，则属里寒重笃之证。热与寒相对，如葛根芩连汤治表里皆热，白虎汤治阳明独盛之热，三承气汤以通下为法，则是治阳明有形之燥热矣。湿与燥相对，茵陈蒿汤、栀子柏皮汤、麻黄连翘赤小豆汤，为治阳明湿热发黄三方；若寒湿发黄，自可于太阴病中理中、四逆辈求之。然此云六气，多侧重于外来致病因素而言，若躯体内部机能失调，亦可产生六气之化。如脾肾阳微，可致内寒，脾虚失运，多成内湿；液燥津枯，阳热生热，治则自可参照太阴、阳明温清等法。至于厥少阴虚阳亢，生风动火，仲景法似未备。然推而广之，柔润滋镇、凉肝滋镇之法，如黄连阿胶、加减复脉诸方，又为温病学者所习用，此则不可不知也。又火为元气之贼，古人并有六气皆从火化之说。证之临床，火病多见，自是事实。仲景方中，如三黄泻心汤治心胃亢盛之火，白虎、竹叶治阳明胃燥之火，柴胡龙牡治肝胆逆冲之火，黄连阿胶治少阴阴虚阳亢之火等。凡此不仅为伤寒立法，即如内伤杂病，亦可借鉴也。
就近世而言，戾气病相对减少。然从所治大江南北、江汉平原地区之内科肠胃疾患看，实以湿热证居多；若肝胆疾患，则多见火化，故用药一涉辛温燥烈，则容易使病机向坏的方面转化。此与阳明、厥阴不从标本而从中见之化，有相暗合者。是知气化一说，求诸临床，征之可信，用事实可以说明者也。从这一角度进行研究，有利于了解在各个不同时期的生理病理状况，但若探求本源，仍然责之于脏腑经络。可见气化离开了脏腑经络，就失去了物质基础；脏腑经络离开了气化，就反映不出功能活动。至于疾病的部位和阶段，在临床上有显著的特征，是诊断学上不可缺少的部分。但是反映在外的部位和阶段，多属表象，还须参合各种因素，寻求其根源所在。因此，必须从临床实际出发，把六经证候和脏腑、经络、气化、部位等有机地结合起来，进行研究，才能正确理解《伤寒论》六经辨证的意义。
（四）力阐六经辨证之底蕴１析六经辨证十法中医学的辨证论治，是根据患者各种不同的具体病况，经过审疾问病等正常诊断程序，作出正确判断和决定合理治疗措施的重要方法。千百年来，广大中医一直沿用至今。辨证论治来源于《伤寒论》。如该书六经篇首，首先标出有“辨太阳病脉证并治”、“辨阳明病脉证并治”等等。所谓病从六经涵义来说，即“太阳之为病”，“阳明之为病”或简称为“太阳病”、“阳明病”。
所谓证，如太阳病以“脉浮，头项强痛而恶寒”为提纲，如兼发热汗出恶风有脉缓，则名为中风，即桂枝证；若兼或已发热，或未发热，身疼腰痛，无汗而喘，脉阴阳俱紧等名为伤寒，即麻黄证。
所谓脉，如太阳表病以浮为主脉，但脉浮中又有浮紧、浮缓、浮数或脉浮而迟等种种不同。所谓治，如表病以发汗为大法，而汗法中又有辛温解肌，调和营卫，而取微汗。从治法深入言之，更有主治、兼治、先治、后治、正治、反治等等不同。《伤寒论》在六经的前提下，对于复杂的致病因素和病理机制的千变万化，运用辨证论治的法则于诊断治疗方面，探讨其一般规律和特殊规律，较为突出的约有以下几点：第三卷１６８（１）辨阴阳：《内经》谓“阴阳者，天地之道也，万物之纲纪，变化之父母，生杀之本始，神明之府也，治病必求于本”（《素问·阴阳应象大论》）。《伤寒论》六经辨证论治的基本规律，主要在于审察机体阴阳的消长，邪正的进退，以判断病变的症结所在和决定采取的合理治疗措施。故辨阴阳一项，实为探本求源的必要之图。
阴阳的涵义，一般是以疾病部位在表在上者为阳；在里在下者为阴。性质属热属实者为阳；属寒属虚者为阴。从六经总的划分：则太阳、阳明、少阳三阳病为阳；太阴、少阴、厥阴三阴病为阴。阳病多呈亢奋性、进行性，故治法以祛邪为主，宜于汗吐下和；阴病多呈退行性、衰减性，则治法自以扶正为主，或用温里扶阳，或宜育阴清热，或寒温并用，邪正兼治。阴阳这一概念，《伤寒论》在辨证论治的具体运用中，大抵可概括为病有阴阳，证有阴阳，脉有阴阳，治有阴阳等四个方面：例如《太阳篇》在辨太阳提纲及风寒温三证之后，紧接着提出“病有发热恶寒者，发于阴也；无热恶寒者，发于阳也”（引自宋本第七条，下同）。盖阳病病邪虽盛，正气犹实，卫外阳气反应较敏，故三阳病多有发热证。如太阳病恶寒发热，少阳病往来寒热，阳明病有身大热、汗自出、不恶寒、反恶热等。阴病则病邪既盛，正气虚衰，抗病机能低下，故三阴病多无发热证。
如三阴虚寒，恶寒卧，甚至厥冷四逆。此为六经发病之通常病况。然太阳伤寒有或未发热者，阳明病有热深厥深者，少阳病有不往来寒热者。至于三阴，太阴病有手足温者，少阴病有反发热或里寒外热者，厥阴虚寒，有先见厥利后转阳回而发热者，此又何故？盖六经病在其发展过程中，因致病因素略有差异影响病机变化，往往可导致证候以另一形式出现，此则多为变局，似不可以此而否定发于阳、发于阴之非。故钱天来、柯韵伯等注家列此条为六经之首，提纲挈领，殊有卓见。
另有“病发于阳，而反下之，热入因作结胸；病发于阴，而反下之，因作痞也”（１３１条）。是因表证误下，阳热陷入，与心胸间痰水相结成实，证有心下胸胁硬满疼痛，此为热实结胸，故谓“病发于阳”。若表证误下，邪热内入，无水气相结，只为心下痞证，故谓“病发于阴”。是阴阳二者，又以结胸与痞以证候对勘而言，可以会意。
《内经》谓“善诊者，察色按脉，先别阴阳”（《素问·阴阳应象大论》）。故仲景脉法，亦以阴阳为辨证纲领。《辨脉法》云：“凡脉大、浮、数、动、滑，此名阳也；脉沉、涩、弱、弦、迟，此名阴也。”盖阳病病位在表，受病较轻，正气充实，营卫气血流行滑利，故脉与之相应，多呈阳盛热实有余之象。反之出现沉涩等脉，则是病邪深入，阴盛阳微，不足之象，较为显著。此条虽属叔和所撰，实是仲景心法。
至于治法，《伤寒论》重在“阴阳自和”（参见５８条）。盖机体因感受外邪或内部脏器功能失调，而使阴阳气呈不相协调状态，即可出现六经中某一种病变。所谓“自和”，当非坐以待愈之