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但是这里就出现了一个bug：为什么matrix一定要用人类来作为能量来源？根据能量守恒定律，人类在产生能量的同时，也在消耗着相同的能量，怎么可能有多余的能量提供给机器运行？而且地球被黑暗笼罩，那么人类赖以生存的空气，食物，水从哪里来？人类又不是土豆，不可能在地下生存的啊。
如果按照莫菲斯的说法，人类是作为电池而存在的，因为太阳能被人类以两败俱伤的方式遮蔽了。这一点着实古怪，大气层的高度一共才多少？科技水平落后的人类能把锡安建立在距离地表两千九百公里的地核附近，更加先进的机器反而面对几百公里的距离就束手无策了吗？（现实社会已经能够建立太空发电站，在卫星上安装太阳能电池板，将太阳能直接转换为电能，再将电能通过微波束发回地面重新转化为电能，一个标准收集站的发电功率可以达到五十亿瓦，相当于五个大型核电厂的发电量）就算不能利用太阳能，风能、地热能、核能总可以吧，人类的生物电实在是太微小了。实在不行，养猪也可以获得生物能啊，不仅繁殖力远远超过人类，而且永远不会出现反抗意识。
每每看到这里，王杨百思不得其解。直到后来查阅了大量资料才逐渐明白，机器这么做也是迫不得已的。
首先，从自然科学的角度上讲，任何封闭系统都会用尽它的秩序（低熵），将走向混沌和混乱（高熵），被人类和机器摧残的地球也不是例外，当地球的资源耗尽（第六代matrix所对应的锡安靠近地心，这说明地球资源开发已经到达地核位置，所有的自然资源即将消耗殆尽），人类和机器的共生是唯一的出路：按照热力学第二定律，封闭系统的熵（系统混乱程度）总是要不断增加。人的思维活动是消耗高熵的食物产生低熵的思维，这个低熵能量正是机器需要的。因为任何能量转化最后的结果都是高熵的、不能被再利用的热能，只有人类是相反的，所以机器要用人类当电池。人高度的秩序的思维能量产生低熵，供机器使用，而机器则提供人类生命的基本需要。
其次，就是进化的需要。我是谁？我从那里来？我为什么而存在？这是所有智慧生命诞生的第一个标志——自我意识的产生。无论它的本体是什么，哺乳动物，植物，或者是机器。不过产生自我意识，只是觉醒的第一步，距离自由所定义的解放自我还有非常遥远的一段路要走。而这段不停走向自由，渴望更高生命层次的路就是进化之路。
在黑客帝国里，机器虽然成功地“翻身农奴把歌唱”，成了地球新的主人，但是在进化之路上，它们却陷入了一个死循环。机器在发展的过程中不断的产生自我；完善自我。虽然更为精致；更为智慧；但这是一再重复着的没有本质变化的原地踏步。无论matrix系统升级了多少代，都只能使得自己更加稳定、更加符合数学和逻辑，却不能实现质的突破，进化成为更高层次的生命形式。
最明显的证据就是，在现实社会里，人类文明终结在1999年，而在matrix中，则不断重复着1999年的社会状况，没有创新，没有进步，即使matrix已经升级到第六代，即使时间已经过去了六个世纪，直到墨菲斯也不能明确地知道具体是哪一年。matrix系统始终在原地转圈，既解决不了作为百分之一存在的系统不稳定因素（自主意识过强的人类），也消除不了作为哥德尔命题存在的救世主（尼奥）。
正如莫菲斯所说，命运确实充满了反讽。当人类目空一切地自以为能够掌控世界的时候，却没有意识到自己制造的人工智能正在成为自己的掘墓人；当机器成为新的统治者、却在为自身进化陷入死循环而焦头烂额的时候，却意外地发现，进化之路的钥匙原来就在被自己评价为低等生命、作为能量来源而进行批量豢养的奴隶——人类手中。机器的本质是一系列的代码和数字，是无穷的是非判断；无论物理架构还是逻辑思维，人类都望尘莫及。但是，人类有情感，有智慧，有丰富的创造力，人类的感性思维和潜藏在骨子里的反叛精神就是生命产生突变的最好土壤。即使只是从数学上讲，机器也不是什么东西都能学习的。人的思维是一个vcdimension无限的函数集。因此，从数学上说，计算机要完全仿真人类思维是做不到的：不论运算能力多强，也不能在全部函数定义域一致收敛。所以锡安必须存在，机器必须和人进行交互，让一部分人有自我独立的思维，通过这些思维升级程序的逻辑，并且利用救世主带回代码置入源程序，升级matrix。
也就是说，锡安这些具有自由意志的人类，对于机器的关键作用，怎么形容都不过分。换位思考一下，这样一个极端重要的、关系到自身进化的存在，会任由他处在无法控制的状态吗？而对于机器来说，最好的控制是什么？还有比虚拟世界更让人放心的所在了吗？只有虚拟空间里的行为才容易被记录和控制，机器的优势就在于这种成体系的精确性。如果是真实世界里的各种现象，尤其是涉及到人类高度私密性的情感活动和非理性行为，机器要系统地记录下来和分析研究，何其难哉？
在这种情况下，既然机器能够创造出第一层matrix，为什么不能创造第二层matrix？
当然，王杨说这些，纯粹只是为了安抚尼奥。以尼奥现在的精神状态，想要让他突然全盘接受这一切太困难了。因为这意味着他之前的一切都被否定了。从一个高级程序员摇身一变，换上了为解放全人类而奋斗的钢铁战士的马甲，这个反差太大了。想要在最短的时间内让这只菜鸟接受现实，最简单有效的方法就是给他描述一个更加严酷的现实。
第一五六章 性格决定命运（）
有了王杨的解析和精神支持，尼奥总算没有当场晕菜。但是他踉踉跄跄径直回到休息舱，就一头栽倒，昏昏沉沉地睡死过去。
看着莫菲斯一副手足无措的模样，王杨转头问道：“我是不是很没心没肺？”
所有人都用奇异的眼光看着他，不知道该怎么回答。
——至少，你让我们很受伤是真的。
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三天后莫菲斯来到尼奥的休息舱，看见尼奥安静的独自坐在房间角落，莫菲斯也慢慢走过去陪在他身边坐下看着他。
沉默了一阵，尼奥怔怔的说：“我回不去了，对吧。”
莫菲斯反问：“要是你能，你真想回去吗？”
尼奥沉默。
莫菲斯低声说道：“尼奥；我向你道歉，我们本来有个规矩是绝对不能解放成人的心灵，因为这样非常危险，成年人会无法接受真相，我见过。我很抱歉这么做，我这么做是因为我别无选择。”
尼奥好奇地看着他。
看了一下尼奥，莫菲斯继续说：“当matrix成形时有一个人在里面出生，他有能力随意改变matrix并重新创造真实世界。他解放了第一批反抗份子，他告诉我们真相，只要matrix存在一天，人类就没有自由。他死后有个先知预言他将再度降临，他将带来matrix的毁灭和战争的终结以及全人类的自由。所以我们终其一生游走matrix中，试图寻找救世主，我这么做是因为，我相信我找到了。”说完盯着尼奥，尼奥转过头来难以置信的回视着他。
莫菲斯随即站起身来拍拍尼奥的肩膀：“好好休息！你需要接受训练。”
看着莫菲斯走出去，尼奥突然问道：“为什么不是王杨？”
莫菲斯在门口停顿了一下：“我不知道。”说完开门离开。
第二天一大早，尼奥的训练正式开始，就像电影中一样，他很快展现出不同寻常的特质，先是如饥似渴地将所有功夫全部学到了手，然后在新编写的搏击程式里打败了莫菲斯，只不过到最后仍然没有通过跳跃程式。。。。。。表现不可谓不惊人，但是有王杨珠玉在前，尼布加尼撒号的船员已经见怪不怪了。
至于王杨，他早已进入尼布加尼撒号的战斗序列，成为正式的一员。除了值班之外，王杨已经很久没有碰过辅助磁碟机了。平时他都在自己的休息舱和主舱里摆弄着一大堆机器零件，也不知道在搞什么。而他鼓捣的那些东西，就连机务员坦克和程序员茂斯也搞不懂。得益于内力修炼带来的神奇效果，在所有人眼中，他似乎有着无限的精力和灵感，没过多久，就没有人再有兴趣继续到他这里来接受打击了。
而关于王杨和尼奥两人的救世主光环问题，成了尼布加尼撒号私下的的争论焦点。
“我还是认为救世主是王杨。”茂斯现在已经成了王杨的粉丝，对王杨神奇的内力和拉风的轻功痴迷之极。并且一直期待拜王杨为师，学习传说中的内力，甚至承诺介绍自己在锡安的妹妹给王杨，据他自己说，他的妹妹相当正点。可是王杨一直拒绝，除了后院的几只母老虎还在虎视眈眈之外，最重要的是茂斯的个性跳脱，过于沉迷于天性中的**——吃个早饭都能扯到人性上，想让他静心入定，达到心如止水的精神修为，不亚于电脑人集体脑残重新遵从机器人三大定律。不过这也难怪，看看他的名字：茂斯，m——o——u——s——e，翻译过来不就是耗子吗？古往今来，耗子能得道的，好像只有释迦牟尼跟前的白毛老鼠精了吧？
“但是先知说。。。。。。”崔妮蒂虽然仍然坚持对莫菲斯的信任，不过底气已经明显不足了。
“拜托！”正所谓百闻不如一见，活生生的事实难道还不能说明问题吗？茂斯对先知开始不那么不感冒了，“也许他现在就能打败特工了。”
艾巴和苏薇琪对视了一眼，打败莫菲斯的一幕犹在眼前，他们纵然不相信王杨能打败特工，至少也不会明面上提出质疑了——起码特工就做不到在墨菲斯毫无知觉的情况下扒掉衣服。所以，他们属于精神上支持莫菲斯，实际行动上投给王杨一票的派别。
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“哇，你差点把我吓死！”
这一天，塞弗正在值班，无意间一回头，差点被无声无息地出现在背后的尼奥吓得三魂不见了七魄。
尼奥歉意地笑笑，又向另一边的王杨打声招呼：“嘿，王杨。”
王杨抬抬手，表示收到。
“要喝一杯吗？还有王杨？”塞弗递给尼奥一个金属杯子，日子一天天过去，王杨和尼奥逐渐习惯了飞船上的生活，对飞船上仅有的几个成员也渐渐熟稔了。并且因为王杨那非人一般的表现，他作为一个新手，威信反而非常之高。连带着尼奥也跟着沾光不少。
“不了，谢谢。”另一边的王杨头也没有抬，专注于自己手中的零件。休息舱和主控室，是他平时最常待的地方，手里永远有着说不出名堂的古怪零件和小玩意。慢慢的，所有人都发现，尼布加尼撒号开始一点一点地发生变化，操纵系统更加灵活，信号传输更加便捷，火控系统更加精确，训练程式更加有针对性，甚至他们对付电子乌贼最有效的武器emp也有了改进：不再仅仅是一次性充能施放，也有了发射引爆的选择。这一切的改进都来自于王杨，他在进入黑客帝国之前，专门向萧宏律学习了适用于这个世界的一些科技资料，虽然绝大多数只是死记硬背下来，但是在尼布加尼撒号上的辅助磁碟机输入系统的知识体系后，这些在关键点上更加先进的科技资料顿时被激活了，这就让王杨可以放手对尼布加尼撒号进行更高级的改装。当然这些东西剧情人物是不知道的，在他们眼中，只看到一系列实用先进的技术成果源源不断地从一个绝顶聪明的天才手中诞生。这也使得尼布加尼撒号船员的救世主之争更加偏向王杨，人类有这样聪明的成员，机器怎么可能获胜？
不过有一点让身在曹营心在汉的塞弗很不满意，那就是王杨在主控室的时候，他想要悄悄潜入matrix去跟特工接头就很不方便了，甚至有一段时间还疑神疑鬼，认为王杨发现了自己的秘密。其实王杨很想跟他说咱们各干各的，你就当我不存在好了。可惜即便他真的这么表示，塞弗也不敢相信。
不过时间长了，塞弗也渐渐发现，王杨根本对其他事情毫无兴趣，一心专注于自己的发明创造，这也让他渐渐放下心来。
从感情上说，王杨其实很能理解塞弗。在面对莫菲斯给出的红色小药丸时，生性浪漫的塞弗一定是浮想联翩——自由啊，多么诱人的字眼！没想到真正的现实却是自由自在地生活在暗无天日的地底，自由自在地吃着吃淡而无味像是浆糊的食品，自由自在地被机械们满地球追杀，然后自由自在地被大卸八块。。。。。。如果不想被这种自由抛弃，就只能在机器来临之际赶快找个下水道最阴暗的旮旯钻进去闷声藏好，然后祈祷别被发现。。。。。。在机器已经统治了全世界的大前提下，以人类那单薄的身体、微量地人口、相较于机械的流水线生产速度慢得可怜的自然繁殖速度、落后地技术兵器。。。。。。人类的翻身之日怎么看都是痴人说梦的一个幻想罢了。
既然大目标不能指望，那么只能退而求其次，个人待遇如果能够解决也可以接受。毫无疑问，崔妮蒂是大美女，尤其是在这种地狱一般的未来世界，美女就更是稀缺资源。虽然没有了matrix的花花世界流连忘返，但是有美相伴，也能在真实的荒漠里稍加安慰了。而且整个团队里，掰着手指头数数，可以说基本上没有能够作为情敌的对手存在：莫菲斯心里有尼俄柏，艾巴明显和苏薇琪更亲近，茂斯只是个嘴上没毛的愤青，再加上朝夕相处同甘共苦的近水楼台之便，这样算来，其实瘸子里面拔将军，塞弗还是很有希望的。
可是等来等去，等来了主角尼奥，长得帅也就算了，头上还顶着一个救世主的光环，刚登上尼布加尼撒号就无视组织纪律把老大莫菲斯菜了，谁知道莫老大不但不以为忤，反倒亲自捧着上位；就连先知这老太太也在一旁跟着瞎起哄。。。。。。长得帅了不起吗？救世主就可以随便插队吗？什么素质！
再怎么埋怨，有了这样一个极品高富帅闪亮登场，还有他什么事儿？这一刻，塞弗同志的心一定是拔凉拔凉的。至此，他留恋人类阵营的最后一丝羁绊——消失了。
在莫菲斯看来，身为人类阵营的一员，摆脱机器的奴役，争取种族的自由，这不是天经地义的吗？要不然，你千辛万苦地从matrix里逃出来干嘛？再说了，你就是想投诚，机器也得愿意要你啊。所以在队伍控制上，一向睿智的莫菲斯却犯了一个很低级的错误：对团队的成员无条件地赋予了全部信任（很像郑吒的说，呵呵呵）。
但是莫菲斯忘了一个最基本的道理，人性是复杂的，也是善变的，好了伤疤忘了痛更是人类最大的劣根性之一。昨天他会觉得做奴隶的滋味糟糕之极，可是对比了这整天被追杀的地老鼠一般的自由人生活，曾经在matrix里被求之不得的真相折磨得夜不能寐的日子便会有意无意地忽略掉，反而觉得其实有时候做做奴隶也是可以接受的，这就是鲁迅先生所说的“暂时做稳了奴隶的人生”和“想做奴隶而不得的人生”了。莫菲斯的缺点就在于他把自己的认知替代了所有人的认知，殊不知人性一旦冥顽不灵起来，就会像周星驰在济公里费尽心机想要度化那个九世乞丐一样，即使你给他做神仙的机会，他的第一反应也是“神仙——乞丐”。
如果说尼奥和莫菲斯代表了人性中真诚、善良、自由、光明的一面，那么塞弗就代表了人性中丑恶、自私、狭隘、保守的一面。
但是理解不代表认同。对于每个人在险恶环境下的选择，王杨一向抱持宽容的态度，只要你没有危害到集体、妨碍到他人，王杨都可以理解。但是像塞弗这样，为了一己之私，出卖团队、甚至背叛族群的做法，王杨绝对不能接受。在王杨看来，你可以选择放弃，但不能选择伤害。
“还是尝尝这个吧。”做完了手里的零件，王杨拿出一个�