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考博生化和分子生物学复习笔记-第17部分

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       (4)脱磷酸作用,即酸性磷酸酶作用。
       (5)RNA内切反应,即RNA限制性内切酶作用。
核酶的生物学意义   1。 RNA为生物催化剂,具有重要生物学意义。  2。打破了酶是蛋白质的传统观念。3。在生命起源问题上,为先有核酸提供了依据。  4。为治疗破坏有害基因,肿瘤等疾病提供手段。
核酶与内含子的关系
       1。目前发现的核酶数量较少,常见于rRNA的内含子。
       2。内含子存在于各种RNA分子中,它们并不都具有核酶的功能。
       3。内含子分为三类:
       (1)内含子可自我剪接;不需任何蛋白质参与;通常分两型…需鸟苷参与。形成套索形式剪接。
       (2)内含子的剪接需要蛋白酶的参与,如tRNA。
    (3)内含子的剪接需形成剪接体的形式,除各种蛋白因子外还需各种snRNP的参与。
真核与原核蛋白质合成的异同
                  真核               原核 
核蛋白体          80S                70S 
含蛋白数量       多于80             少于60 
小亚基结构    无嘧啶区和互补区     含嘧啶区与互补 
tRNA              tRNAimet          tRNAfmet 
启动    eIF 9…10种 需ATP          小亚基先与tRNA结合,在与mRNA结合
延长             EF1;EF2             EFTu EFTs 
终止             RF 需 GTP          RF1,RF2,RF3
肽链的加工与修饰  合成后的多肽需经一定的加工,修饰或互相聚合才有活性。
肽链水解修饰:例如无活性的酶原转变为有活性的酶,常需要去掉一部分肽段。酶原与蛋白质转变修饰的场所不同,酶原多是在细胞外转变为酶,一些蛋白质前身物多是在高尔基体去掉部分肽链。
修饰:肽链需进行化学修饰后才能参与正常的生理活动,化学修饰的种类如下:
    磷酸化:磷酸化酶b 
    羟化:胶元蛋白前体中的脯aa;赖aa。
    脂化:脂蛋白要加脂。
    乙酰化:组蛋白进行乙酰化。
    甲基化:细胞色素C;肌蛋白。
    糖基化:在粗面内质网糖苷化与肽链合成同时进行。
亚单位的聚合  许多功能复杂的蛋白质;由两条以上肽链及其它辅助成分通过非共价键聚合形成多聚体才有活性。
分泌蛋白的合成与加工  靶向输送(protein targeting):将合成后的蛋白质;定向到达行使功能目标地的过程;为靶向输送。
    1。两类核蛋白体:1)种附着与粗面内质网;为膜结合型核蛋白;合成分泌蛋白含信号肽。2)另一游离于胞质中;参与细胞固有蛋白质的合成
    2。信号肽 (1)信号肽作用:使核蛋白体与内质网上的受体结合,合成的肽链进入内质网内腔运至靶器官,信号肽酶可切除信号肽,使成熟的蛋白质释放至胞外。 (2)信号肽结构:约10…40多个氨基酸构成;分三个区:
    N端为亲水区含碱性氨基酸; 提供正电荷。    疏水区含中性或疏水性氨基酸。    加工区是信号肽酶切割信号肽的部位。
  3。参与转运的分子
    (1)信号肽识别粒子(Signal recognition particles… SRP):由6种蛋白质与7S…RNA组成复合体。
    '信号肽识别粒子SRP的作用':    与合成的分泌蛋白中的信号肽结合。   参加与内质网上受体结合的反应。
    (2)7S…RNA:由305bp组成;提供SRP形成的结构骨架。
    (3)对接蛋白(docking protein… Dp):对接蛋白是SRP的受体,与SRP共同催化转运携有肽链的核蛋白体到内质网上。
  4。分泌蛋白的转运过程    (1)信号肽被信号肽识别粒子(SRP)结合,SRP把核蛋白体带至胞膜的胞浆面与对接蛋白结合,核蛋白体与内质网膜结合。    (2)信号肽被信号肽酶切割掉,蛋白质分泌到内质网腔。
蛋白质合成的阻断剂  蛋白质生物合成自复制、转录和翻译的不同过程均有抑制剂能加以阻断。抑制剂包括抗菌素和毒素等。
    抗生素
     四环素族:(土霉素等)    '作用':抑制氨基酰…tRNA与原核细胞的小亚基结合;此类抗生素不易进入哺乳动物细胞。
    氯霉素:(红霉素)    '作用'与原核细胞的大亚基结合;对真核线立体合成有阻断作用。
    放线菌酮与嘌呤霉素    '作用'前者抑制转肽酶;后者使肽链过早脱落;均对真核的翻译过程有抑制作用。
   毒素类阻断剂
    白喉毒素    '白喉毒素的作用' 抑制哺乳类动物的延长因子EFT2的活性。
    '白喉毒素的结构' 由A;B两条链组成;A链起催化作用;B链辅助进入细胞。
    '作用机制' 毒素催化EFT2中的特殊氨基酸与NAD作用;使EFT2失活。
    蓖麻蛋白(植物毒素)    '蓖麻蛋白的结构':A链'毒性链';B链'结合链';二条链以二硫键相连。
    '作用机制':B链附着于细胞膜;经二硫键还原,A链释出进入细胞与大亚基结合,间接抑制EFT2的作用。
  其它蛋白类阻断剂
    干扰素(interferon;IF)    病毒感染宿主后,细胞产生一类蛋白因子,它抑制病毒的繁殖保护宿主。
    '干扰素分型':白细胞产生的为a…干扰素;成纤维细胞生成b…干扰素;淋巴细胞合成g…干扰素。
    '作用原理':当双链RNA病毒存在时; 干扰素使病毒蛋白质合成受抑制,使病毒无法繁殖。
    '作用机制':    1、当双链RNA病毒存在时,干扰素活化一种蛋白激酶;激酶使启动因子eIF2磷酸化而失活,从而抑制蛋白合成。
    2、干扰素间接活化一种核酸内切酶,此酶使病毒mRNA降解;从而阻断蛋白质合成。
化学修饰与别构调节的异同点????共同点:均通过影响酶的结构,转而影响酶的活性。
????不同点: 
代谢途径
酶催化
共价键改变 
能量
别构调节
调节关键酶改变代谢方向 
不需要

不一定需要
化学修饰
以放大效应调节代谢
需要

需要
生物氧化反应的类型    生物体内的氧化反应类型与体外(一般化学)氧化反应类型相同,即脱电子、脱氢、加氧。生物氧化反应中脱下的电子或氢原子不能游离存在,必须由另一物质接受,接受氢或电子的反应为还原反应。所以体内的氧化反应总是和还原反应偶联进行的,称为氧化还原反应。其中,失去电子或氢原子的物质称为供电子体或供氢体,接受电子或氢原子的物质称为受电子体或受氢体。
生物氧化反应的酶类    生物氧化是在一系列酶的催化下进行的。催化生物氧化的酶可分为四类:氧化酶类、脱氢酶类、加氧酶类、氢过氧化酶类。后两种酶类参与线粒体外的生物氧化过程,将在第三节介绍;下面介绍前两种酶类,它们参与线粒体内的生物氧化过程。
一)氧化酶类  如抗坏血酸氧化酶(植物中多见)、细胞色素氧化酶(Cyt aa3)、酪氨酸氧化酶等催化作用物脱氢氧化,氧分子接受氢生成水。二)脱氢酶类  根据是否需要氧作为受氢体,可将脱氢酶分为需氧脱氢酶和不需氧脱氢酶。
    1.需氧脱氢酶    以FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)、FMN(黄素单核苷酸)为辅基,因而亦称为黄素蛋白或黄酶。此类酶催化作用物脱氢并以氧为受氢体,产物为H2O2而不是H2O。人们习惯将需氧脱氢酶也称为氧化酶,如胺氧化酶、黄嘌呤氧化酶等。
   2.不需氧脱氢酶    此类酶的辅酶或辅基为NAD+、NADP+、FAD、FMN等。其所催化的脱氢反应最为重要,脱下的氢被其辅酶或辅基接受,生成相应的还原型辅酶或辅基如NADH+H+、NADPH+H+、FADH2、FMNH2等。其中NADH+H+、FADH2、FMNH2作为呼吸链的组成成分,NADPH+H+则在脂肪酸、胆固醇等物质的生物合成中起作用。乳酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、琥珀酸脱氢酶等均属于这一类酶。
   生物氧化过程中生成的CO2并不是代谢物上的碳原子与吸入的氧直接化合的结果,而是有机酸脱羧作用生成的。根据所脱羧基在有机酸分子中的位置,可将脱羧反应分为α-脱羧和β-脱羧;又根据反应的同时是否伴有氧化反应,分为单纯脱羧和氧化脱羧。
 一、α…脱羧    1.α-单纯脱羧    如氨基酸在氨基酸脱羧酶作用下脱去羧基,生成胺和CO2。
          2.α-氧化脱羧    丙酮酸+CoASH+NAD+→乙酰辅酶A+CO2+NADH+H+。
 二、β-脱羧    1.β-单纯脱羧    草酰乙酸→丙酮酸+ CO2(酶为丙酮酸羧化酶)
                2.β-氧化脱羧    苹果酸+NAD+→丙酮酸+CO2+NADPH+H+
呼吸链中各递氢体和递电子体的顺序排列是根据大量实验结果推出来的。
  首先,根据呼吸链中各组分的氧化还原电位由低到高的顺序推出呼吸链中电子的传递方向为从NADH经辅酶Q、细胞色素体系到氧。
  其次,利用呼吸链中的不少组分具有特殊的吸收光谱,而且得失电子后其吸收光谱发生改变。如NAD+因含AMP,故在260nm处有一吸收峰,而当还原成NADH+H+后,则在340nm处出现一个新的吸收峰;FP因含黄素在370nm和450nm处有吸收峰,但当还原后,450nm处的吸收峰消失。因此在其全部处于还原状态时,缓慢通入氧气,利用分光光度法测定各组分的吸收峰的改变顺序,从而判断呼吸链中各组分的排列顺序。所得结果与第一种方法相同。
 第三,利用一些特异的抑制剂阻断呼吸链的电子传递,那么阻断部位以前的电子传递体就会处于还原状态,而阻断部位以后的电子传递体则处于氧化状态。因此通过分析不同阻断情况下各组分的氧化还原状态,就可推出呼吸链各组分的排列顺序。 
 另外,当用去垢剂温和处理线粒体内膜时,得到了四种电子传递复合体。它们也按一定的顺序排列。
血糖指血液中的葡萄糖,主要供其他组织利用,特别是大脑几乎完全靠可通过血脑屏障的葡萄糖供能。血糖供应不足时,神经功能受损。因此维持血糖在70…110 mg/dl这个正常浓度范围甚为重要。
一、 血糖的来源与去路
 来源: 食物中糖的消化吸收     肝糖原的分解    非糖物质的糖异生
 去路: 氧化分解成CO2和H2O,并生成能量    合成肝糖原和肌糖原    转变成非糖物质如脂类和氨基酸等    转变成其他糖类如磷酸戊糖等    超过肾糖阈随尿排出
二、血糖水平的调节    血糖之所以能维持恒定,主要是血中葡萄糖的来源和去路每时每刻都保持平衡,血糖的恒定实际是身体各个组织在糖酵解、糖氧化、糖原合成与分解、糖异生种种代谢协同的结果。各种代谢途径的调节前面已有叙述,此处归纳一下几种激素对血糖的影响,它们的影响也是通过一些调节酶的激活或抑制而实施的。
 降血糖激素    胰岛素是体内唯一的降血糖激素,它的作用有几个方面:
       (1) 促进葡萄糖进入细胞
       (2) 抑制糖原磷酸化酶,激活糖原合酶,加速肌、肝糖原的合成。
       (3) 激活丙酮酸脱氢酶,加速丙酮酸脱羧生成乙酰辅酶A。
       (4) 抑制磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶的活性,降低糖异生。
       (5) 减少脂肪组织动员脂肪酸,促进糖的有氧氧化。
 升血糖激素 1。胰高血糖素    胰高血糖素抑制丙酮酸激酶和6磷酸果糖激酶1,增高果糖二磷酸酶活性,促进脂肪组织分解,促进糖异生。
        2。糖皮质激素    促进肌肉蛋白质分解,增加糖异生原料,抑制肝外组织摄取葡萄糖,从而提高血糖。 
        3。肾上腺素     激活磷酸化酶,加快糖原分解,肝释出葡萄糖,肌肉输出乳酸供肝糖异生,这在应激时起作用。 
血糖水平异常
1。高血糖及糖尿症 空腹血糖为7。22…7。78 mmol/L时称高血糖。肾糖阈为血糖8。89…10。00/L,当血糖值超过肾糖阈时,糖随尿排出,常见原因为糖尿病。  2。低血糖  空腹血糖为3。33…3。89 mmol/L造成低血糖,常见于胰性、肝性疾病,内分泌异常,肿瘤或饥饿状态。
ATP的利用与储存  虽然人类一切生理活动所需的能量主要糖、脂类等物质的分解代谢,但糖、脂类等物质中所蕴涵的能量必须转化为ATP形式方可被利用。所以ATP是机体所需能量的直接供给者。如肌肉收缩、神经传导、生物合成、吸收与分泌等过程所需能量均ATP。另外,在一些物质的合成过程中除需要ATP外还需其它高能磷酸化合物参与,如糖原合成过程中需要UTP,磷脂合成时需CTP,蛋白质合成时需GTP参与。但UTP、CTP、GTP等高能磷酸化合物的生成和补充有赖于ATP。    在肌肉和脑组织中,ATP可将其高能磷酸键转移给肌酸生成磷酸肌酸(CP),此反应由肌酸激酶(CPK)催化。磷酸肌酸为能量的贮存形式,其所含的高能磷酸键不能直接被利用,当肌肉和脑组织中ATP不足时,磷酸肌酸可将其高能磷酸键转移给ADP生成ATP,为生理活动提供能量。生化分子考研复习 经典 笔记 
》氨基酸的重要化学反应
反应基团   试剂   主要产物   应用 P
α…NH2 茚三酮 紫色、红色物 对氨基酸显色 63
α=NH2 茚三酮 黄色物 Pro的鉴定 
α…NH2 HNO2 N2等 游离aa定量,蛋白质水解程度 59
α…NH2 DNFB二硝基氟苯Sanger试剂 DNP…aa二硝基苯黄色物 蛋白质N端测定一级结构分析标准图谱 6181
α…NH2 PITC苯异硫氰酸酯Edman试剂 PTC…aa在无水的酸中环化成PTH…aa 蛋白质N端测定一级结构分析aa顺序自动分析仪标准图谱 82
α…NH2 甲醛 羟甲基…aa和二羟甲基…aa 甲醛滴定aa含量(封闭氨基) 60
Arg的胍基 α…萘酚次溴酸钠坂口试剂 桃红色物 鉴定Arg 
Met的…S…CH3 H2O2 过氧化物 吸烟有害,烟中的过氧化物,弹性蛋白酶,抑制剂Met,肺气肿。 
Cys的…SH 碘代乙酸ICH2COOH过甲酸HCOOOH 乙酸硫基HOOC…CH2…S…磺基HS3O… 肽链拆分,作用与CYSS上的二硫键 65
His的咪唑基 重氮苯磺酸Pauly试剂 樱红色物(1His连2重) 鉴定His 65…66
Tyr的酚基 重氮苯磺酸Pauly试剂 桔黄色物 鉴定Tyr 
Tyr的酚基 磷钼酸、磷钨酸Folin试剂 兰色物质 定量测定蛋白质、Tyr 
Trp的吲哚基 对二甲基氨基苯甲醛 兰色物质 鉴定Trp 
…OHSer、Thr、Tyr 激酶、ATP P…aa 调节酶的活性,测定酶的活性中心 65
蛋白质的颜色反应:可以用来定量定性测定蛋白质
双缩脲反应:红色,λm=540nm
黄色反应:与HNO3的反应,生成硝基苯,呈黄色。皮肤遇到HNO3的情况,白→黄→橙黄。
米伦氏反应:与HgNO3 或HgNO2的反应,呈黄色,原理同上。
与乙醛酸的反应:红色,Trp的吲哚基的特定反应。
坂口反应:红色,Arg的胍基的反应。
福林反应:蓝色,是Tyr的酚基与磷钼酸和磷钨酸的反应。
印三酮反应:紫红色
Pauly反应:樱红色,His的咪唑基。
密码表中的几个重要密码子(8个):
起始密码:无论原核还是真核都是AUG,原核生物对应的是fMet,真核生物对应的是Met。极少数原核生物用GUG,对应fMet。不作起始密码时,也就是处于中间时,AUG对应的是Met,GUG对应Val。
终止密码:UAA、                  UAG、                       UGA,                它们是空密码,不对应任何AA。
易记密码:AAA:Lys
GGG:Gly
CCC:Pro
UUU:Phe
单核糖体:1个大亚基+1个小亚基,原核70S(50+30),真核80S(60+40),S不能简单的相加。见P503或讲义P49草图
多聚核糖体:由一条mRNA串起来的多个核糖体,见P509或讲义P49草图。 功能
结合mRNA:夹在大亚基和小亚基之间。
结合氨酰tRNA、肽酰tRNA:在大亚基上。
A位:结合氨酰tRNA的部位,Amino…,      第一个氨酰tRNA例外。
P位:结合肽酰tRNA的部位,Peptide…,    fMet…tRNAfMet例外。
E位:结合空载tRNA,Exit
形成肽键:由肽酰转移酶作用,最新的发现表明此酶由rRNA(原核23S)来充当。

牛脾磷酸二酯酶SPDase 外切酶 DNA、RNA 从5’端作用(要求5’端有游离的5’…OH);切点HO…Np↓…… 3’…NMP
蛇毒磷酸二酯酶VPDase 外切酶 DNA、RNA 从3’端作用(要求3’端有游离的3’…OH); 切点……↓pN…OH 5’…NMP
磷酸单酯酶Pmase 外切酶 DNA、RNA 去掉端点核苷酸的游离磷酸根,见P141p↓N……N↓p 端点有游离的…OH

牛胰核糖核酸酶RnaseⅠ 内切酶 RNA 左边为Py,切点见P140…Pyp↓N… 3’端Py核苷酸具有游离的3’…○P
核糖核酸酶T1Rnase T1 内切酶 RNA 左边为G,切点见P140…Gp↓N… 3’端G核苷酸具有游离的3’…○P
核糖核酸酶U2Rnase U2 内切酶 RNA 左边为Pu,切点见P140…Pup↓N… 3’端Pu核苷酸具有游离的3’…○P

Southern Blotting(南印迹):用于钓基因,
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