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TRIzol法同时提取RNA;DNA;蛋白质
TRIzol试剂适用于从细胞和组织中快速分离RNA。TRIzol试剂有多组分分离作用;与其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、盐酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特点是可同时分离一个样品的RNADNA蛋白质.TRIzol使样品匀浆化,细胞裂解,溶解细胞内含物,同时因含有RNase抑制剂可保持RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液分为水相和有机相,RNA在水相中。取出水相用异丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中间层可回收DNA;用异丙醇沉淀有机相可回收蛋白质。
TRIzol试剂可用于小量样品(50…100mg组织、5×106细胞)也适用于大量样品(≥1g组织、》107细胞)。对人,动物,植物组织,细菌均适用,可同时处理大量不同样品,整个提取过程在一小时内即可完成。分离的总RNA无蛋白质和DNA污染,可用于Northern Blot,dot blot,ployA筛选,体外翻译,RNase保护分析和分子克隆。在用于RT…PCR时如果两条引物存在于一个单一外显子内,建议用无RNase的DNaseⅠ处理RNA样品,避免出现假阳性。共纯化的DNA可用作标准,比较不同样品RNA的得率,也可用于PCR和酶切。蛋白质可用于Western Blotting。
规格:100ml 黄色透明液体
储存条件:2…8℃避光保存12个月
注意:请勿直接接触皮肤或吞咽,以免灼伤。如接触皮肤应立即用洗涤剂和大量水冲洗。忌用乙醇擦洗,乙醇会加重灼伤程度。
预防RNase污染注意事项:
1。经常更换新手套,皮肤上常带有的细菌,霉菌可能成为RNase的来源。
2。使用灭过菌的RNA专用塑料制品避免交叉污染。
3。RNA在TRIzol试剂中时不会被RNase污染,但提取后继续处理过程中应使用不含RNase的塑料和玻璃器皿。玻璃器皿可在150℃烘烤4小时,塑料制品可在0。5M NaOH中浸泡10分钟,然后用水彻底清洗,高压灭菌,即可去除RNase。
4。配制溶液应使用无RNase的水(将水加入处理过不含RNase的玻璃瓶中,加入DEPC至终浓度0。01℅v/v;放置过夜;高压灭菌。注:DEPC有致癌之嫌,需小心操作。)
RNA的提取
准备试剂:氯仿,异丙醇,75℅乙醇,无RNase的水或0。5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制)
操作步骤:
1。 匀浆处理:a。组织 将组织在液氮中磨碎;每50…100mg组织加入1ml TRIzol;用匀浆仪进行匀浆处理。样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
b。单层培养细胞 直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3。5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
c.细胞悬液 离心收集细胞,每5…10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1ml TRIzol,反复吸打。加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。
2.将匀浆样品在室温(15…30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。
3.可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2…8℃10000×g离心10分钟,取上清。离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。取澄清的匀浆液进行下一步操作。
5。 每使用1ml TRIzol加入0。2ml氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。
6。 2…8℃10000×g离心15分钟。样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。
7。 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。用异丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0。5ml异丙醇,室温放置10分钟。
8。 2…8℃10000×g离心10分钟,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。移去上清。
9。 用75℅乙醇洗涤RNA沉淀。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75℅乙醇。2…8℃不超过7500×g离心5分钟,弃上清。
10。室温放置干燥或真空抽干RNA沉淀,大约晾5…10分钟即可。不要真空离心干燥,过于干燥会导致RNA的溶解性大大降低。加入25…200μl无RNase的水或0。5℅SDS;用枪头吸打几次;55…60℃放置10分钟使RNA溶解。如RNA用于酶切反应;勿使用SDS溶液。RNA也可用100℅的去离子甲酰胺溶解,…70℃保存。
注意事项:
1。从少量样品(1…10mg组织或102…104细胞)中提取RNA时可加入少许糖原以促进RNA沉淀。例如加800ml TRIzol匀浆样品,沉淀RNA前加5…10μg RNase…free糖原。糖原会与RNA一同沉淀出来,糖原浓度不高于4mg/ml是不影响第一链的合成,也不影响PCR反应。
2.匀浆后加氯仿之前样品可以在…60至…70℃保存至少一个月。RNA沉淀可以保存于75% 酒精中2…8℃一星期以上或…5至…20℃一年以上。
3.分层和RNA沉淀时也可使用台式离心机,2600×g离心30…60分钟。
预期产量:1mg组织或1×106细胞提取RNA分别为:
肝和脾6…10μg ;肾3…4μg ;骨骼肌和脑组织1…1。5μg ;胎盘1…4μg ;上皮细胞8…15μg ;成纤维细胞5…7μg 。
常见问题分析:
得率低:A。样品裂解或匀浆处理不彻底
B.RNA沉淀未完全溶解
A260/A28012000×g离心10分钟除去。
DNA的定量:取一份溶于8mM NaOH的DNA加水测A260值。一单位A260值相当于50μg/ml双链DNA。根据DNA产量可估计细胞数,人,大鼠,小鼠1×106二倍体细胞含DNA的量分别为7。1μg ; 6。5μg ; 5。8μg 。
预期产量:1mg组织或1×106细胞提取DNA分别为肝和肾3…4μg 骨骼肌,脑组织,胎盘2…3μg 人,大鼠,小鼠培养细胞(1×106)5…7μg 成纤维细胞5…7μg
应用:1。用于PCR 溶于8mM NaOH的DNA用0。1M HEPES调pH至8。4;取0。1…1μg DNA用作模板。
2。酶切反应 用HEPES或1mM EDTA调节pH至适当值。每μg DNA使用3…5单位的酶,80…90%的DNA是可消化的。
1ml 8mM NaOH溶解的DNA样品pH值调节
Final pH 0。1M HEPES(μl) Final pH 1M HEPES(μl)
8。4 86 7。2 23
8。2 93 7。0 32
8。0 101
7。8 117
7。5 159
注意事项:
1。 DNA在中间层和有机相中时可在2…8℃保存过夜。
2.DNA沉淀在75%乙醇中2…8℃可保存几个月。
3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置过夜,如长期保存需用HEPES调节pH至7…8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或…20℃长期保存。
常见问题分析:
得率低:A。样品匀浆和裂解的不彻底
B.最终得到的DNA沉淀没有完全溶解
A260/A280